中西医兴起于不同的文化背景——中医兴起于农业文明，西医兴起于工业文明。 中西医学在早期都共同经历了起源阶段、巫史医学、经验医学等阶段。总体上看，13世纪以前的中国医学一直处于世界领先地位，远远领先于西方医学。在农耕社会里，洪水经常泛滥，如何治水是人们生存的一大考验。面对灾情，一家一户的力量是弱小的，无法战胜肆虐的洪水，人们必须共同合作，互相帮助。

人们通常会寻求与自己同一血缘的宗族成员为合作对象，于是人们聚族而居，进行广泛的联合。在大禹治水的时代，这种以宗族为基础的宗法社会机制就开始酝酿，夏商时代，各种宗族及等级制度得到完善和发展。 西周时期，宗法制最终形成，天子是全国最大的“大宗”，各级“小宗”必须结合在天子周围，对天子无限崇敬，这就是“敬宗”。其他各级宗族成员都要以各级“宗子”为核心，表示“尊祖”和“敬宗”。

从家庭中依赖父母到宗族中依靠长辈，再到国家中依赖天子，形成了独具特色的，以血缘为纽带的“家国一体”的宗法社会。血缘促成共同利益的高度一致，从而产生强烈的排他性，小到对外姓氏族的排斥，大到对异邦势力的抗拒。这种宗法意识深刻地影响国人的性格和文化，在医学上的体现就是“上以疗君亲之疾”，要事君、要奉亲、要嗣子，并以此为出发点。在医业的继承与人才培养方面，则表现出承启家学、秘不外授、世代相传等特点，这限制了中医学的发扬光大，也导致许多优秀的中医文化遗产中途失传，后继无人。

在中国的农耕文明形态中，个体力量弱小，而王权强大，这也就为专制主义埋下了伏笔。在血缘宗族或宗派集团社会里，最高统治集团可以随意剥夺其他集团的利益，而不受到任何外部力量的制约。最高集团的意志高于法律，他们可以任意利用法律、破坏法律，法律仅是他们手上的一种工具。医家作为独立的个人，他们的命运操纵在最高统治者手中，有许多优秀的医家被最高统治者所杀害，如《吕氏春秋·至忠》记载文挚用激怒的办法治好了齐王的病，最后被齐王所杀；三国时期名医华佗被曹操所杀等。

名医被害，这本身就是对医学的重大摧残。 工业与商业紧密联系，在商业活动中，人们作为经济活动的主体，独立地开展经济活动，他们拥有一定的私有财产，没有基于经济关系而产生的人身依附关系，个人与个人之间是协商或契约关系。人有独立意识，会为维护自己的合法权益而斗争。法律是社会管理的基本手段，法律具有至高无上的权威，任何个人或集团都不能凌驾其上，法治追求民主、平等和社会的公平正义。

在雅典，全体自由的成年男子均可参加作为国家最高权力机关的公民大会，讨论和决定国家的重大事情，国家尊重公民独立的人格，并保证和发展公民的个性。民主政治的发展保障了医家的生命不被随意剥夺，同时促进了商业的繁荣，为医学的发展创造了条件。文艺复兴以后，欧洲自然科学发生了飞跃式的发展，自然科学的发展带动了医学的发展，西医开始大踏步地前进。此时，中医虽然也在缓慢地发展，但是与西医的差距不断被拉开。

中西医学两种不同的发展轨迹与两种文化有着密切的关联，中医根植于农业文化，而西医兴起于工业文化，两种文化造成的思维习惯、认知等方面有诸多不同。人类文明的产生是多元的，大陆文明与海洋文明尽管存在着明显的差异，但是在整体上并没有文野之分，也无高下之别，两者彼此取长补短，彼此互动，在相互冲突中前进，在交融中发展，都对世界文明的发展产生重要影响，都是人类共有的不可缺少的珍贵遗产。